Protein–RNA interactions for Protein: Q3UUV9

H2-Eb2, Histocompatibility 2, class II antigen E beta2, mousemouse

Predictions only

Length 287 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb2Q3UUV9 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
H2-Eb2Q3UUV9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Gm12251-201ENSMUST00000117893 792 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
H2-Eb2Q3UUV9 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms