Protein–RNA interactions for Protein: Q3UTD9

Smim15, Small integral membrane protein 15, mousemouse

Predictions only

Length 74 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim15Q3UTD9 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Cavin3-201ENSMUST00000047040 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Stk11-201ENSMUST00000003152 2566 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Morf4l1-202ENSMUST00000169860 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Gsc2-201ENSMUST00000012279 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Smim15Q3UTD9 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Ppia-202ENSMUST00000132846 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Mpnd-208ENSMUST00000159996 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Paqr9-201ENSMUST00000079597 8367 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Shc4-202ENSMUST00000110477 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Zfp318-201ENSMUST00000113481 7850 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Anp32a-201ENSMUST00000085519 2113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Tada1-201ENSMUST00000027846 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Smim15Q3UTD9 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms