Protein–RNA interactions for Protein: Q3UQD6

D630036H23Rik, RIKEN cDNA D630036H23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D630036H23RikQ3UQD6 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
D630036H23RikQ3UQD6 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
D630036H23RikQ3UQD6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
D630036H23RikQ3UQD6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
D630036H23RikQ3UQD6 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
D630036H23RikQ3UQD6 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
D630036H23RikQ3UQD6 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
D630036H23RikQ3UQD6 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
D630036H23RikQ3UQD6 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
D630036H23RikQ3UQD6 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
D630036H23RikQ3UQD6 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
D630036H23RikQ3UQD6 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
D630036H23RikQ3UQD6 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
D630036H23RikQ3UQD6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
D630036H23RikQ3UQD6 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
D630036H23RikQ3UQD6 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
D630036H23RikQ3UQD6 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
D630036H23RikQ3UQD6 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
D630036H23RikQ3UQD6 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
D630036H23RikQ3UQD6 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
D630036H23RikQ3UQD6 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
D630036H23RikQ3UQD6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
D630036H23RikQ3UQD6 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
D630036H23RikQ3UQD6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
D630036H23RikQ3UQD6 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
D630036H23RikQ3UQD6 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
D630036H23RikQ3UQD6 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
D630036H23RikQ3UQD6 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
D630036H23RikQ3UQD6 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
D630036H23RikQ3UQD6 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
D630036H23RikQ3UQD6 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
D630036H23RikQ3UQD6 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
D630036H23RikQ3UQD6 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
D630036H23RikQ3UQD6 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
D630036H23RikQ3UQD6 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
D630036H23RikQ3UQD6 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
D630036H23RikQ3UQD6 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
D630036H23RikQ3UQD6 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
D630036H23RikQ3UQD6 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
D630036H23RikQ3UQD6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
D630036H23RikQ3UQD6 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
D630036H23RikQ3UQD6 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
D630036H23RikQ3UQD6 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
D630036H23RikQ3UQD6 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
D630036H23RikQ3UQD6 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
D630036H23RikQ3UQD6 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
D630036H23RikQ3UQD6 Gm4881-201ENSMUST00000206705 1152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
D630036H23RikQ3UQD6 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms