Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPV3

E130208F15Rik, RIKEN cDNA E130208F15 gene, mousemouse

Predictions only

Length 143 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E130208F15RikQ3UPV3 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Twist2-201ENSMUST00000007949 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
E130208F15RikQ3UPV3 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC13.51□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Gm12821-201ENSMUST00000120022 600 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Gm5576-201ENSMUST00000075809 1236 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
E130208F15RikQ3UPV3 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms