Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMU9

Hdgfl2, Hepatoma-derived growth factor-related protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl2Q3UMU9 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Uqcrfs1-201ENSMUST00000042834 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Cnr1-201ENSMUST00000057188 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd33b-203ENSMUST00000110410 2070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Gm26646-201ENSMUST00000180715 1490 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Rasl11b-201ENSMUST00000051937 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
Hdgfl2Q3UMU9 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Slc30a4-201ENSMUST00000005952 5458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Gm572-201ENSMUST00000105698 1385 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Klc3-201ENSMUST00000047170 1901 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Dusp26-201ENSMUST00000036631 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Spast-202ENSMUST00000224711 2066 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
Hdgfl2Q3UMU9 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC19.47■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.1 ms