Protein–RNA interactions for Protein: Q3UMR0

Ankrd27, Ankyrin repeat domain-containing protein 27, mousemouse

Predictions only

Length 1,048 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd27Q3UMR0 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Zfp385b-204ENSMUST00000111831 2734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Tk2-201ENSMUST00000050211 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Cyp4f16-201ENSMUST00000003416 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Col4a3bp-202ENSMUST00000109444 5285 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Lfng-201ENSMUST00000031555 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Mrgprf-202ENSMUST00000117718 1935 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Chmp7-201ENSMUST00000036381 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Shkbp1-201ENSMUST00000003857 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Gm5784-201ENSMUST00000179344 2478 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 2810474O19Rik-201ENSMUST00000046689 6066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Rarb-207ENSMUST00000225921 2756 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Kirrel-201ENSMUST00000041732 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Ankrd27Q3UMR0 Slc9a5-201ENSMUST00000073149 3499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd27Q3UMR0 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd27Q3UMR0 Cacng4-201ENSMUST00000021066 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd27Q3UMR0 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd27Q3UMR0 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd27Q3UMR0 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd27Q3UMR0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd27Q3UMR0 Tmem178-201ENSMUST00000025092 1696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd27Q3UMR0 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd27Q3UMR0 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd27Q3UMR0 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd27Q3UMR0 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd27Q3UMR0 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd27Q3UMR0 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd27Q3UMR0 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd27Q3UMR0 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ankrd27Q3UMR0 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd27Q3UMR0 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd27Q3UMR0 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd27Q3UMR0 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ankrd27Q3UMR0 Dnaja4-201ENSMUST00000070070 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms