Protein–RNA interactions for Protein: Q3UM29

Cog7, Conserved oligomeric Golgi complex subunit 7, mousemouse

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cog7Q3UM29 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Ramp1-202ENSMUST00000165855 852 ntTSL 2 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Otud1-201ENSMUST00000052168 2832 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Cog7Q3UM29 Whamm-201ENSMUST00000165460 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Dedd-203ENSMUST00000111299 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC20.33■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Dlg1-202ENSMUST00000064477 4663 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Abhd13-202ENSMUST00000139793 5191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Cog7Q3UM29 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC20.27■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Larp1-203ENSMUST00000178636 6617 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Rps6ka3-201ENSMUST00000033671 7244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Cog7Q3UM29 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms