Protein–RNA interactions for Protein: Q3UKU1

Ell2, RNA polymerase II elongation factor ELL2, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ell2Q3UKU1 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC23.97■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Ell2Q3UKU1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Znrf3-201ENSMUST00000109867 6311 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ell2Q3UKU1 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.7 ms