Protein–RNA interactions for Protein: Q3UJC8

Uncharacterized protein C5orf34 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3UJC8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Q3UJC8 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Q3UJC8 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC27.09■■□□□ 1.93
Q3UJC8 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Q3UJC8 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Q3UJC8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Q3UJC8 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Q3UJC8 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Q3UJC8 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Q3UJC8 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Q3UJC8 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
Q3UJC8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Q3UJC8 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Q3UJC8 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Q3UJC8 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Q3UJC8 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q3UJC8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q3UJC8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
Q3UJC8 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC27.03■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
Q3UJC8 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Q3UJC8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Q3UJC8 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Gm43859-201ENSMUST00000200075 1412 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Q3UJC8 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Q3UJC8 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Q3UJC8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms