Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEN2

Fam35a, Protein FAM35A, mousemouse

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Length 891 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam35aQ3UEN2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam35aQ3UEN2 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam35aQ3UEN2 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Fam35aQ3UEN2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam35aQ3UEN2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam35aQ3UEN2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam35aQ3UEN2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam35aQ3UEN2 Gm10941-201ENSMUST00000105408 708 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam35aQ3UEN2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam35aQ3UEN2 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam35aQ3UEN2 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam35aQ3UEN2 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam35aQ3UEN2 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam35aQ3UEN2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Fam35aQ3UEN2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam35aQ3UEN2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam35aQ3UEN2 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam35aQ3UEN2 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam35aQ3UEN2 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Fam35aQ3UEN2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Coq10a-201ENSMUST00000043211 1421 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Irx2-201ENSMUST00000074372 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Tor2a-208ENSMUST00000177382 396 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Ppa1-201ENSMUST00000020286 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Zfp105-201ENSMUST00000051667 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Bola1-202ENSMUST00000107099 995 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 D630036H23Rik-201ENSMUST00000171007 940 ntAPPRIS P1 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Rabgap1l-216ENSMUST00000195442 1877 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 AC104834.1-201ENSMUST00000222611 1056 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Fam35aQ3UEN2 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fam35aQ3UEN2 Slc16a10-201ENSMUST00000092566 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Fam35aQ3UEN2 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam35aQ3UEN2 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam35aQ3UEN2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam35aQ3UEN2 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam35aQ3UEN2 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam35aQ3UEN2 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam35aQ3UEN2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam35aQ3UEN2 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Fam35aQ3UEN2 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam35aQ3UEN2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam35aQ3UEN2 Mpz-201ENSMUST00000070758 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam35aQ3UEN2 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Fam35aQ3UEN2 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam35aQ3UEN2 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Fam35aQ3UEN2 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Fam35aQ3UEN2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms