Protein–RNA interactions for Protein: Q3UEB3

Puf60, Poly(U)-binding-splicing factor PUF60, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 564 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Puf60Q3UEB3 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC27.56■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC27.56■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 CT025689.6-201ENSMUST00000224991 1104 ntBASIC27.55■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.55■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC27.54■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC27.53■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.53■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC27.52■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
Puf60Q3UEB3 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Puf60Q3UEB3 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Puf60Q3UEB3 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Puf60Q3UEB3 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC27.51■■□□□ 1.99
Puf60Q3UEB3 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Puf60Q3UEB3 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Puf60Q3UEB3 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Puf60Q3UEB3 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC27.5■■□□□ 1.99
Puf60Q3UEB3 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Puf60Q3UEB3 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.5■■□□□ 1.99
Puf60Q3UEB3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Puf60Q3UEB3 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Puf60Q3UEB3 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Puf60Q3UEB3 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Puf60Q3UEB3 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC27.49■■□□□ 1.99
Puf60Q3UEB3 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.49■■□□□ 1.99
Puf60Q3UEB3 Gm12504-201ENSMUST00000120860 2231 ntBASIC27.49■■□□□ 1.99
Puf60Q3UEB3 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Puf60Q3UEB3 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Puf60Q3UEB3 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.48■■□□□ 1.99
Puf60Q3UEB3 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Puf60Q3UEB3 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Puf60Q3UEB3 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Puf60Q3UEB3 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Puf60Q3UEB3 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Puf60Q3UEB3 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Puf60Q3UEB3 Rab6b-202ENSMUST00000189134 716 ntTSL 3 BASIC27.47■■□□□ 1.99
Puf60Q3UEB3 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.46■■□□□ 1.99
Puf60Q3UEB3 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Puf60Q3UEB3 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Puf60Q3UEB3 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Puf60Q3UEB3 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Puf60Q3UEB3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.44■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC27.43■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC27.42■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.42■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC27.41■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Gucd1-211ENSMUST00000219774 806 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Puf60Q3UEB3 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms