Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDR8

Yipf3, Protein YIPF3, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Yipf3Q3UDR8 Panx2-203ENSMUST00000162424 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Yipf3Q3UDR8 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Yipf3Q3UDR8 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Yipf3Q3UDR8 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Yipf3Q3UDR8 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Yipf3Q3UDR8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Yipf3Q3UDR8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.7
Yipf3Q3UDR8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Yipf3Q3UDR8 Acot2-201ENSMUST00000021649 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Tmem145-201ENSMUST00000108409 2298 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Kat14-201ENSMUST00000028911 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Fbxw5-201ENSMUST00000015239 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Dio3-202ENSMUST00000173014 2030 ntAPPRIS P1 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Pxk-201ENSMUST00000036682 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Fgfr3-202ENSMUST00000087820 2630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Minpp1-201ENSMUST00000025827 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Clcc1-203ENSMUST00000106613 3064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Prss16-201ENSMUST00000006341 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Dnpep-204ENSMUST00000185797 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Spata2l-201ENSMUST00000098327 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 B3gnt2-202ENSMUST00000062844 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Map6-206ENSMUST00000208605 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Igsf9b-201ENSMUST00000115247 2857 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Yipf3Q3UDR8 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Glra1-203ENSMUST00000108853 1797 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Hes7-201ENSMUST00000024543 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 5330438D12Rik-201ENSMUST00000064101 2229 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Mtmr1-201ENSMUST00000015358 4634 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Zc3h14-202ENSMUST00000057000 3046 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Yipf3Q3UDR8 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms