Protein–RNA interactions for Protein: Q3U898

Cops9, COP9 signalosome complex subunit 9, mousemouse

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Length 57 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cops9Q3U898 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Mad2l2-201ENSMUST00000030860 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.68□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Simc1-202ENSMUST00000121401 4819 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.67□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC13.66□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Schip1-205ENSMUST00000182532 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Mdga1-208ENSMUST00000171691 8339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Ankhd1-214ENSMUST00000155329 8223 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.66□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Gm43653-201ENSMUST00000198136 1608 ntTSL 3 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC13.65□□□□□ -0.22
Cops9Q3U898 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Kcnip2-209ENSMUST00000162528 2395 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Shisa7-201ENSMUST00000066041 6006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Actr3b-201ENSMUST00000088244 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.64□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Mreg-201ENSMUST00000048860 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Map7-201ENSMUST00000020173 4252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.63□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Tesmin-204ENSMUST00000151341 2013 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Rbm38-204ENSMUST00000173393 2071 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.62□□□□□ -0.23
Cops9Q3U898 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.62□□□□□ -0.23
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