Protein–RNA interactions for Protein: Q3U595

UPF0545 protein C22orf39 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 105 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q3U595 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q3U595 Map2k2-207ENSMUST00000143517 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U595 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U595 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U595 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U595 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U595 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U595 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U595 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U595 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U595 Dip2c-203ENSMUST00000174552 8023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q3U595 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U595 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U595 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U595 Arfrp1-203ENSMUST00000127988 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U595 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U595 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U595 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U595 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U595 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U595 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U595 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U595 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U595 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U595 Lmbr1l-201ENSMUST00000023736 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U595 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U595 Slc9a2-203ENSMUST00000192345 2507 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q3U595 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U595 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U595 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U595 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U595 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U595 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U595 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q3U595 Rab3il1-201ENSMUST00000113161 2225 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U595 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U595 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U595 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U595 Gm7143-201ENSMUST00000222811 859 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U595 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U595 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q3U595 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q3U595 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q3U595 Fam189a1-201ENSMUST00000119118 4801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U595 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U595 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U595 Kcnn4-202ENSMUST00000205428 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U595 Ttc9-202ENSMUST00000218362 4754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U595 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U595 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U595 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U595 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U595 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U595 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U595 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U595 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U595 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U595 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U595 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U595 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U595 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U595 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U595 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U595 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U595 Hook2-203ENSMUST00000209764 2516 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U595 B130046B21Rik-201ENSMUST00000181510 2216 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U595 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U595 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q3U595 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U595 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U595 Cyb561-201ENSMUST00000019734 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U595 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U595 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U595 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U595 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U595 Rabac1-201ENSMUST00000076961 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U595 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U595 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U595 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U595 Rps6ka2-201ENSMUST00000024575 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U595 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U595 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q3U595 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U595 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U595 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U595 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U595 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U595 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U595 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U595 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U595 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U595 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U595 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q3U595 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U595 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U595 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U595 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U595 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U595 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q3U595 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.3 ms