Protein–RNA interactions for Protein: Q3U515

Vwce, von Willebrand factor C and EGF domain-containing protein, mousemouse

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VwceQ3U515 E130116L18Rik-201ENSMUST00000066954 306 ntAPPRIS P1 BASIC18.78■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Cryzl1-203ENSMUST00000117644 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Gas5-217ENSMUST00000161005 430 ntTSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
VwceQ3U515 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC18.76■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Eif2ak4-207ENSMUST00000110877 2134 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Dgcr6-209ENSMUST00000155387 1415 ntTSL 3 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.75■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Cacnb1-205ENSMUST00000107562 1745 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Gm14281-201ENSMUST00000121700 1294 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Gm15556-201ENSMUST00000122904 663 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC18.74■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 0610038B21Rik-202ENSMUST00000184762 1524 ntBASIC18.74■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Cox7c-202ENSMUST00000078764 433 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VwceQ3U515 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Akt1s1-204ENSMUST00000107885 1812 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC18.7■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VwceQ3U515 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms