Protein–RNA interactions for Protein: Q3U4B1

Ssbp4, Single stranded DNA binding protein 4, isoform CRA_b, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ssbp4Q3U4B1 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Akr7a5-201ENSMUST00000073787 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Tmem171-201ENSMUST00000064347 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Nabp2-201ENSMUST00000026439 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 AC122828.1-201ENSMUST00000220785 489 ntTSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Spaca1-201ENSMUST00000029927 1197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Spaca1-202ENSMUST00000084734 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ssbp4Q3U4B1 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Pianp-204ENSMUST00000160704 1116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 AC099934.2-201ENSMUST00000196389 70 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 AC156953.1-201ENSMUST00000196953 70 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 AC157822.2-201ENSMUST00000200291 70 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Rfc5-202ENSMUST00000111953 772 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm10129-202ENSMUST00000193100 1316 ntBASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Lzts2-202ENSMUST00000178087 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Emc6-202ENSMUST00000108480 563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Tmbim4-201ENSMUST00000020446 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 H2-Ke6-201ENSMUST00000045467 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Wdr4-203ENSMUST00000167419 813 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ssbp4Q3U4B1 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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