Protein–RNA interactions for Protein: Q3U2A8

Vars2, Valine--tRNA ligase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vars2Q3U2A8 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Ankrd13d-201ENSMUST00000056888 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Mthfsl-201ENSMUST00000113110 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Mthfs-203ENSMUST00000118870 705 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Mthfs-201ENSMUST00000085256 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Vars2Q3U2A8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC25.14■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Cbx3-201ENSMUST00000031862 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC25.1■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Tmem91-201ENSMUST00000079439 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Tex264-203ENSMUST00000169068 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Vars2Q3U2A8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.06■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Gm10638-201ENSMUST00000098532 905 ntAPPRIS P1 BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Cdh4-203ENSMUST00000108911 1208 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Tex30-204ENSMUST00000128190 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Vars2Q3U2A8 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.2 ms