Protein–RNA interactions for Protein: Q3U155

Ccdc174, Coiled-coil domain-containing protein 174, mousemouse

Predictions only

Length 467 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc174Q3U155 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Mgll-202ENSMUST00000113581 1308 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Tekt5-201ENSMUST00000043415 1803 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Paip2-203ENSMUST00000115735 1521 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Rnaseh2b-201ENSMUST00000022499 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Agmat-201ENSMUST00000038161 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Rps7-203ENSMUST00000221871 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Zmym3-202ENSMUST00000117637 1593 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Ccdc174Q3U155 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Krtap5-2-202ENSMUST00000190456 1471 ntAPPRIS P2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Srsf1-202ENSMUST00000107920 1209 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 D830025C05Rik-201ENSMUST00000059474 976 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Deptor-203ENSMUST00000100660 1377 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Parl-201ENSMUST00000048642 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 1700023F06Rik-202ENSMUST00000107026 1127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Ccdc174Q3U155 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms