Protein–RNA interactions for Protein: Q3TYV2

Hhla1, HERV-H LTR-associating protein 1 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hhla1Q3TYV2 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Ly6h-204ENSMUST00000127095 1336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Rtl8b-201ENSMUST00000088778 1232 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Hhla1Q3TYV2 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 B3galnt1-201ENSMUST00000061826 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 A230065N10Rik-201ENSMUST00000172178 1028 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Lgals7-201ENSMUST00000081457 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Sh3gl1-201ENSMUST00000003268 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Ypel3-204ENSMUST00000106359 469 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Hhla1Q3TYV2 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.1 ms