Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWI9

Tmem63b, CSC1-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 832 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem63bQ3TWI9 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Sdhaf1-201ENSMUST00000098586 2490 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Rhob-201ENSMUST00000067384 2349 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Sult4a1-201ENSMUST00000082365 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Tmem63bQ3TWI9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 5730488B01Rik-201ENSMUST00000192889 2311 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Gab2-202ENSMUST00000206791 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 S100a6-201ENSMUST00000001051 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Tmem63bQ3TWI9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Tmem63bQ3TWI9 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem63bQ3TWI9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem63bQ3TWI9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem63bQ3TWI9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem63bQ3TWI9 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Tmem63bQ3TWI9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms