Protein–RNA interactions for Protein: Q3TVA9

Ccdc136, Coiled-coil domain-containing protein 136, mousemouse

Predictions only

Length 1,136 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc136Q3TVA9 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ccdc136Q3TVA9 Ankrd37-201ENSMUST00000053558 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ccdc136Q3TVA9 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ccdc136Q3TVA9 L3mbtl4-201ENSMUST00000093007 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ccdc136Q3TVA9 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Ccdc136Q3TVA9 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC34.81■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC34.8■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC34.8■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Klc3-204ENSMUST00000108459 1849 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Tmem42-202ENSMUST00000213514 631 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 4930413G21Rik-201ENSMUST00000205998 993 ntBASIC34.78■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
Ccdc136Q3TVA9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Ccdc136Q3TVA9 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Ccdc136Q3TVA9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Ccdc136Q3TVA9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.15
Ccdc136Q3TVA9 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ccdc136Q3TVA9 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ccdc136Q3TVA9 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Ccdc136Q3TVA9 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
Ccdc136Q3TVA9 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ccdc136Q3TVA9 AI507597-201ENSMUST00000140726 880 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ccdc136Q3TVA9 Anapc13-204ENSMUST00000190279 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ccdc136Q3TVA9 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ccdc136Q3TVA9 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ccdc136Q3TVA9 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Ccdc136Q3TVA9 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ccdc136Q3TVA9 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ccdc136Q3TVA9 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ccdc136Q3TVA9 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ccdc136Q3TVA9 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ccdc136Q3TVA9 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC34.73■■■■□ 3.15
Ccdc136Q3TVA9 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
Ccdc136Q3TVA9 Aurkaip1-203ENSMUST00000105592 1029 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ccdc136Q3TVA9 Nfe2l3-203ENSMUST00000160133 1125 ntTSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
Ccdc136Q3TVA9 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ccdc136Q3TVA9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
Ccdc136Q3TVA9 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ccdc136Q3TVA9 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ccdc136Q3TVA9 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ccdc136Q3TVA9 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
Ccdc136Q3TVA9 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC34.7■■■■□ 3.14
Ccdc136Q3TVA9 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ccdc136Q3TVA9 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ccdc136Q3TVA9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ccdc136Q3TVA9 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ccdc136Q3TVA9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ccdc136Q3TVA9 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ccdc136Q3TVA9 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ccdc136Q3TVA9 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ccdc136Q3TVA9 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ccdc136Q3TVA9 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
Ccdc136Q3TVA9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ccdc136Q3TVA9 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ccdc136Q3TVA9 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ccdc136Q3TVA9 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ccdc136Q3TVA9 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC34.68■■■■□ 3.14
Ccdc136Q3TVA9 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ccdc136Q3TVA9 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ccdc136Q3TVA9 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Ccdc136Q3TVA9 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 338.8 ms