Protein–RNA interactions for Protein: Q3TMP1

Gtf3c3, General transcription factor IIIC, polypeptide 3, mousemouse

Predictions only

Length 882 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c3Q3TMP1 Csnk1a1-210ENSMUST00000170862 2259 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Clk3-201ENSMUST00000065330 2496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Rela-201ENSMUST00000025867 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 D130020L05Rik-203ENSMUST00000221044 803 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Rab42-201ENSMUST00000040411 761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gabbr1-209ENSMUST00000174456 1595 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5540-201ENSMUST00000131852 1848 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Tpm1-211ENSMUST00000113695 1607 ntTSL 3 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Gm44949-201ENSMUST00000206423 1450 ntBASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Pgam1-201ENSMUST00000011896 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Prmt3-201ENSMUST00000032715 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Slc25a16-201ENSMUST00000044977 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Mzt1-201ENSMUST00000042662 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Adamtsl5-201ENSMUST00000095446 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Tmub1-202ENSMUST00000115033 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Neto2-205ENSMUST00000216286 2932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 E130208F15Rik-201ENSMUST00000098585 1733 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Bspry-202ENSMUST00000107449 2167 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Ahsa2-201ENSMUST00000020529 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Asph-217ENSMUST00000146441 2576 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Nipa2-202ENSMUST00000117812 3039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Gtf3c3Q3TMP1 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Gtf3c3Q3TMP1 Csf1-203ENSMUST00000120243 2097 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms