Protein–RNA interactions for Protein: Q3TDV8

Zfp444, Zinc finger protein 444, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 331 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp444Q3TDV8 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Zfp444Q3TDV8 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Zfp444Q3TDV8 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Zfp444Q3TDV8 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zfp444Q3TDV8 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zfp444Q3TDV8 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zfp444Q3TDV8 Kmt5b-201ENSMUST00000005518 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zfp444Q3TDV8 Slc35d3-201ENSMUST00000059805 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zfp444Q3TDV8 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zfp444Q3TDV8 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zfp444Q3TDV8 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Zfp444Q3TDV8 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zfp444Q3TDV8 Sapcd2-203ENSMUST00000114293 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zfp444Q3TDV8 E4f1-201ENSMUST00000056032 2574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Zfp444Q3TDV8 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zfp444Q3TDV8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zfp444Q3TDV8 Ptar1-201ENSMUST00000099560 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zfp444Q3TDV8 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zfp444Q3TDV8 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Zfp444Q3TDV8 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zfp444Q3TDV8 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Zfp444Q3TDV8 Hcn2-201ENSMUST00000020581 3089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zfp444Q3TDV8 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zfp444Q3TDV8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zfp444Q3TDV8 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zfp444Q3TDV8 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zfp444Q3TDV8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
Zfp444Q3TDV8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Zfp444Q3TDV8 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Zfp444Q3TDV8 Sstr1-201ENSMUST00000044299 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zfp444Q3TDV8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zfp444Q3TDV8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zfp444Q3TDV8 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zfp444Q3TDV8 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zfp444Q3TDV8 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Zfp444Q3TDV8 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC25.82■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 Samd10-201ENSMUST00000060173 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 Cracr2b-201ENSMUST00000053670 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 Sost-201ENSMUST00000001534 2066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.79■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 Gm20100-201ENSMUST00000209418 2272 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 Pnldc1-201ENSMUST00000163394 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 Hexa-201ENSMUST00000026262 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 Lrfn4-201ENSMUST00000053597 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC25.78■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 1700095J03Rik-201ENSMUST00000143715 1808 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Zfp444Q3TDV8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Copz2-201ENSMUST00000018816 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Bend7-204ENSMUST00000184139 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Foxf2-201ENSMUST00000042054 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Pdpk1-205ENSMUST00000115411 1724 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Hnrnph3-202ENSMUST00000118898 2168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 AC117245.1-201ENSMUST00000215481 566 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Tsen54-202ENSMUST00000106481 1862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Ak2-202ENSMUST00000102604 1781 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Zfp444Q3TDV8 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.4 ms