Protein–RNA interactions for Protein: Q3TCJ8

Ccdc69, Coiled-coil domain-containing protein 69, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc69Q3TCJ8 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Ubxn2a-203ENSMUST00000142867 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Snap91-203ENSMUST00000074501 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Trmt112-201ENSMUST00000088257 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Lig3-204ENSMUST00000131537 1782 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Lig3-209ENSMUST00000173009 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Ccdc69Q3TCJ8 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Pxdc1-202ENSMUST00000053459 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Cdv3-ps-201ENSMUST00000169632 827 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
Ccdc69Q3TCJ8 Pcgf6-201ENSMUST00000026032 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms