Protein–RNA interactions for Protein: Q31093

H2-M3, Histocompatibility 2, M region locus 3, mousemouse

Predictions only

Length 336 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M3Q31093 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Lacc1-201ENSMUST00000062789 2444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Bicdl2-201ENSMUST00000062967 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Gm9828-202ENSMUST00000126622 1446 ntTSL 3 BASIC19.25■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Gm11586-201ENSMUST00000123060 566 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Gm14486-201ENSMUST00000144704 644 ntTSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 1700064M15Rik-201ENSMUST00000185726 645 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Rfxap-204ENSMUST00000217267 696 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Gm21964-202ENSMUST00000213641 1649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 1110004F10Rik-201ENSMUST00000032899 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Ubxn1-202ENSMUST00000166407 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Rps2-ps10-202ENSMUST00000170335 965 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
H2-M3Q31093 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 AC138214.1-201ENSMUST00000223838 420 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Gm27045-201ENSMUST00000182145 1402 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Ly6h-206ENSMUST00000156032 752 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 9530036O11Rik-201ENSMUST00000180878 876 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Ly6h-201ENSMUST00000023241 906 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Ccdc85c-201ENSMUST00000136175 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
H2-M3Q31093 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms