Protein–RNA interactions for Protein: Q2VPR5

Hdgfl1, Hepatoma-derived growth factor-like 1, mousemouse

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdgfl1Q2VPR5 Ttyh3-201ENSMUST00000042661 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Dhx36-201ENSMUST00000029336 5620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Atxn2-201ENSMUST00000051950 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Adrb1-201ENSMUST00000038949 2491 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Tpm1-212ENSMUST00000113696 1714 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Htra2-203ENSMUST00000113963 1629 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Cdk8-201ENSMUST00000031640 2973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Meg3-207ENSMUST00000143836 1896 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Rims1-209ENSMUST00000218140 1434 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Dcbld1-203ENSMUST00000218582 2795 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Spire1-203ENSMUST00000115050 5405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Hdgfl1Q2VPR5 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Becn1-217ENSMUST00000172233 1493 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Gm11532-201ENSMUST00000128111 5272 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 D030062O11Rik-201ENSMUST00000192660 2806 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Rexo5-201ENSMUST00000033218 1966 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Hmg20b-203ENSMUST00000105324 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Tram1-201ENSMUST00000027068 2938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Glrb-201ENSMUST00000029654 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC21.3■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Zfp644-205ENSMUST00000112698 5689 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Atp11a-201ENSMUST00000033818 7549 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Cln5-201ENSMUST00000022721 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Hdgfl1Q2VPR5 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms