Protein–RNA interactions for Protein: Q2PFD7

Psd3, PH and SEC7 domain-containing protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 1,037 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psd3Q2PFD7 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Lsm12-201ENSMUST00000021297 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Psd3Q2PFD7 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Stbd1-201ENSMUST00000050952 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Bspry-201ENSMUST00000030088 1757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Psd3Q2PFD7 2310034G01Rik-201ENSMUST00000189008 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Nkpd1-203ENSMUST00000214205 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Fah-201ENSMUST00000032865 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Psd3Q2PFD7 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 72.8 ms