Protein–RNA interactions for Protein: Q2LKU9

Nlrp1a, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1a, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nlrp1aQ2LKU9 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Gm12063-201ENSMUST00000148087 715 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 AC114678.1-201ENSMUST00000219640 622 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Gm15270-201ENSMUST00000125158 870 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Nlrp1aQ2LKU9 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Wbp1-201ENSMUST00000032111 1419 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 AC137127.1-201ENSMUST00000213466 1078 ntBASIC24■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Gm11650-201ENSMUST00000141271 1145 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp428-201ENSMUST00000071361 1182 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Fam149b-204ENSMUST00000090503 2053 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Gm43909-201ENSMUST00000203443 1876 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Myadml2-201ENSMUST00000026134 931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Gramd1a-202ENSMUST00000085636 2543 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Wdsub1-202ENSMUST00000102751 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 AC161052.2-201ENSMUST00000220969 1375 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Rnf39-202ENSMUST00000173072 631 ntTSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Nlrp1aQ2LKU9 Ndufaf1-201ENSMUST00000028768 1451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Rab7-205ENSMUST00000113600 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Gtpbp2-217ENSMUST00000172170 2587 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Acvrl1-206ENSMUST00000121718 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Msx1-201ENSMUST00000063116 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Aplp1-201ENSMUST00000006828 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Nlrp1aQ2LKU9 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1113.9 ms