Protein–RNA interactions for Protein: Q1A3B0

Cers3, Ceramide synthase 3, mousemouse

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Length 383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cers3Q1A3B0 Gm9988-201ENSMUST00000069786 435 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Gm15298-201ENSMUST00000145916 1212 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Faim-201ENSMUST00000035038 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 D830036C21Rik-201ENSMUST00000207444 453 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Setd4-202ENSMUST00000113951 1826 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cers3Q1A3B0 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Zfp467-201ENSMUST00000101443 599 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Fbxw2-202ENSMUST00000091020 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Atg3-201ENSMUST00000023343 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 D030056L22Rik-201ENSMUST00000055792 1631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Gm44899-202ENSMUST00000209433 511 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Derl2-207ENSMUST00000171041 1466 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Speg-206ENSMUST00000122266 917 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 1700125G02Rik-201ENSMUST00000154947 519 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Gpx1-202ENSMUST00000191997 787 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Ptrh1-201ENSMUST00000066352 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Gpx1-201ENSMUST00000082429 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Aktip-202ENSMUST00000120213 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Stmn4-203ENSMUST00000120229 1281 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Smim1-209ENSMUST00000145527 562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Nfkbid-203ENSMUST00000108176 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Clta-202ENSMUST00000107846 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Cers3Q1A3B0 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 A930001C03Rik-204ENSMUST00000154407 1402 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Cnp-201ENSMUST00000103120 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Fbxo6-202ENSMUST00000056965 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Jkamp-201ENSMUST00000057257 1292 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cers3Q1A3B0 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
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