Protein–RNA interactions for Protein: Q0ZUP1

Klrb1, Killer cell lectin-like receptor subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 214 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Klrb1Q0ZUP1 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Inhbb-201ENSMUST00000038765 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Soat2-201ENSMUST00000023806 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 1810022K09Rik-201ENSMUST00000108365 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Thap8-201ENSMUST00000014072 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Siglec15-201ENSMUST00000170760 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Lmo1-202ENSMUST00000207178 912 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 AC164441.1-202ENSMUST00000223430 442 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 E130218I03Rik-201ENSMUST00000122952 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Kirrel3-202ENSMUST00000115148 2851 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Mapk11-201ENSMUST00000088823 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Klrb1Q0ZUP1 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Picalm-215ENSMUST00000209068 3511 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Spcs1-207ENSMUST00000228767 1008 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Fyn-204ENSMUST00000126486 2495 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Gm43017-201ENSMUST00000198296 752 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Klrb1Q0ZUP1 Bcl10-201ENSMUST00000029842 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms