Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGU4

Vgf, MCG18019, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VgfQ0VGU4 Gmds-201ENSMUST00000041859 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Tead2-201ENSMUST00000033060 2140 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Tex264-202ENSMUST00000163441 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.69■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Arl6ip4-201ENSMUST00000031351 1192 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Prkab1-201ENSMUST00000031486 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Pla2g12a-201ENSMUST00000029629 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Gm29394-204ENSMUST00000177504 448 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Fbxl15-202ENSMUST00000177667 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Syt6-205ENSMUST00000121834 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Slc9a7-201ENSMUST00000072451 2512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Camk1-201ENSMUST00000032409 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Cdkl3-202ENSMUST00000063321 2008 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 1700105P06Rik-201ENSMUST00000186160 1772 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Gsc-201ENSMUST00000021513 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Ltb4r2-201ENSMUST00000044554 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Flvcr1-202ENSMUST00000191946 1216 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Ercc6l2-208ENSMUST00000144763 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
VgfQ0VGU4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.64■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Rps2-208ENSMUST00000170715 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Nipsnap2-201ENSMUST00000086046 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Apoe-205ENSMUST00000173739 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Apoe-209ENSMUST00000174355 1104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Cbln2-201ENSMUST00000068423 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Trp73os-201ENSMUST00000143429 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 B630019K06Rik-201ENSMUST00000064196 2583 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 4930519A11Rik-202ENSMUST00000221053 667 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Hspb1-201ENSMUST00000005077 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Dnajb2-206ENSMUST00000187058 1732 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
VgfQ0VGU4 Zfp69-201ENSMUST00000106280 2362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms