Protein–RNA interactions for Protein: Q0VGT2

Gli2, Zinc finger protein GLI2, mousemouse

Predictions only

Length 1,544 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gli2Q0VGT2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Shisa5-202ENSMUST00000112059 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Ccr10-201ENSMUST00000062759 1726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
Gli2Q0VGT2 1700001C19Rik-201ENSMUST00000061885 1622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC28.82■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Myl6-206ENSMUST00000218127 691 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC28.81■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Hhex-201ENSMUST00000025944 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC28.79■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Rbm38-201ENSMUST00000029014 1768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Gm12473-201ENSMUST00000137535 579 ntTSL 5 BASIC28.77■■■□□ 2.2
Gli2Q0VGT2 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Gm26524-201ENSMUST00000192339 390 ntBASIC28.76■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.76■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC28.75■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC28.75■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Henmt1-202ENSMUST00000098680 1466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.74■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Gli2Q0VGT2 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.2 ms