Protein–RNA interactions for Protein: Q0VG85

Ccdc162p, Coiled-coil domain-containing protein 162, mousemouse

Predictions only

Length 912 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc162pQ0VG85 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Atf6b-201ENSMUST00000015605 2566 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Gm2464-202ENSMUST00000194841 877 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Rbfox3-202ENSMUST00000069343 1553 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Plekha1-211ENSMUST00000151119 2397 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Iars2-203ENSMUST00000110975 2801 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Meis3-205ENSMUST00000176506 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 AC126028.2-201ENSMUST00000228100 1833 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Gm26708-203ENSMUST00000208236 1624 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a38-201ENSMUST00000035106 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Slc39a5-202ENSMUST00000167859 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Vegfa-207ENSMUST00000142351 1973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Tesmin-201ENSMUST00000025840 2234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Tifa-201ENSMUST00000054483 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Lrrc36-204ENSMUST00000213547 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Gm16192-201ENSMUST00000148357 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Elf2-212ENSMUST00000194641 5919 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Ccdc162pQ0VG85 Fiz1-204ENSMUST00000207030 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 C230037L18Rik-201ENSMUST00000136218 1886 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Numbl-201ENSMUST00000079258 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Trib3-201ENSMUST00000040312 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Trmt11-201ENSMUST00000019927 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Lgr4-201ENSMUST00000046548 5060 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Smarcad1-201ENSMUST00000031984 5168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Slc17a7-202ENSMUST00000209634 1860 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Sox17-208ENSMUST00000195555 1977 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Nol9-202ENSMUST00000103197 2271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Pus1-201ENSMUST00000031481 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Krt24-201ENSMUST00000017255 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 4930507D05Rik-201ENSMUST00000181110 1834 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Slc25a4-201ENSMUST00000034049 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm38399-201ENSMUST00000112103 1645 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Khk-204ENSMUST00000201621 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Tcea2-201ENSMUST00000103042 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ccdc162pQ0VG85 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms