Protein–RNA interactions for Protein: Q0VBF2

Tmem52b, Transmembrane protein 52B, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem52bQ0VBF2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Foxo3-202ENSMUST00000105501 1316 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Uqcrc1-201ENSMUST00000026743 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Mfsd4a-202ENSMUST00000112365 1536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Tmem52bQ0VBF2 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Kiss1-205ENSMUST00000195286 656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Bag1-201ENSMUST00000030125 1295 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Tomm40-201ENSMUST00000032555 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Rgs19-201ENSMUST00000002532 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Hotairm1-201ENSMUST00000129546 409 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Lemd3-201ENSMUST00000119093 4370 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Rell2-212ENSMUST00000177058 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Gm9207-201ENSMUST00000198773 1115 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Pou3f1-201ENSMUST00000053491 3849 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Tmem230-206ENSMUST00000180286 1531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Bag5-202ENSMUST00000160576 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Evi5l-209ENSMUST00000177053 1542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
Tmem52bQ0VBF2 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19 ms