Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Gm44732-201ENSMUST00000208055 635 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Diablo-203ENSMUST00000111587 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 2510002D24Rik-202ENSMUST00000123146 361 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Gm20760-201ENSMUST00000179197 648 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Stum-202ENSMUST00000179826 601 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Hnrnpab-203ENSMUST00000109103 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Ndufaf1-202ENSMUST00000110801 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Hgfac-206ENSMUST00000202573 434 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Shisa6-201ENSMUST00000066679 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Prrx2Q06348 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Cyyr1-204ENSMUST00000175700 1294 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Hoxa2-201ENSMUST00000014848 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Cacng7-201ENSMUST00000092891 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Cdan1-202ENSMUST00000110701 6384 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Nrl-203ENSMUST00000178694 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 March11-201ENSMUST00000126304 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Ddah2-201ENSMUST00000007255 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Nsfl1c-202ENSMUST00000089140 1486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Tbxa2r-201ENSMUST00000105325 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Gm14207-203ENSMUST00000156538 988 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Stn1-201ENSMUST00000049369 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Prrx2Q06348 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms