Protein–RNA interactions for Protein: Q04890

Sox12, Transcription factor SOX-12, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox12Q04890 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC27■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Fam228b-205ENSMUST00000218575 1281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Tmem54-203ENSMUST00000106064 1066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 1700003N22Rik-201ENSMUST00000194834 808 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Snrpc-201ENSMUST00000071006 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Tmprss5-205ENSMUST00000170246 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Sebox-202ENSMUST00000125670 1300 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Zfp444-202ENSMUST00000108565 849 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Prmt1-210ENSMUST00000208829 621 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Hoxa11os-201ENSMUST00000134512 1839 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Polr3gl-201ENSMUST00000091924 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC26.95■■□□□ 1.91
Sox12Q04890 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sox12Q04890 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sox12Q04890 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sox12Q04890 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sox12Q04890 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sox12Q04890 Rrad-201ENSMUST00000034351 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sox12Q04890 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sox12Q04890 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sox12Q04890 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sox12Q04890 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sox12Q04890 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sox12Q04890 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC26.93■■□□□ 1.9
Sox12Q04890 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sox12Q04890 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sox12Q04890 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sox12Q04890 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sox12Q04890 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sox12Q04890 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sox12Q04890 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sox12Q04890 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sox12Q04890 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sox12Q04890 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sox12Q04890 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Sox12Q04890 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sox12Q04890 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sox12Q04890 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sox12Q04890 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Sox12Q04890 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sox12Q04890 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sox12Q04890 Uncx-202ENSMUST00000174792 1196 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sox12Q04890 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sox12Q04890 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Gm39115-201ENSMUST00000211350 699 ntAPPRIS P1 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Ntn5-201ENSMUST00000107742 1574 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 2410004B18Rik-201ENSMUST00000039571 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Tgfbr3l-201ENSMUST00000110993 1075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Med30-201ENSMUST00000037115 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.86■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 AC122428.2-201ENSMUST00000216321 1832 ntBASIC26.86■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Olfr173-201ENSMUST00000049940 1164 ntAPPRIS P1 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sox12Q04890 C230096K16Rik-201ENSMUST00000198074 1722 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 93.5 ms