Protein–RNA interactions for Protein: Q04886

Sox8, Transcription factor SOX-8, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sox8Q04886 Apoe-201ENSMUST00000003066 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Sox8Q04886 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Cotl1-202ENSMUST00000168698 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Gm13063-201ENSMUST00000132247 669 ntTSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Matr3-209ENSMUST00000188275 1951 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 AB124611-203ENSMUST00000173769 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Gm43060-201ENSMUST00000200621 289 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Pgam5-201ENSMUST00000059229 2044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Rnaseh1-201ENSMUST00000020959 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Sox8Q04886 1700030C10Rik-201ENSMUST00000110971 1471 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Art5-201ENSMUST00000094128 1518 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Anapc1-202ENSMUST00000110332 1214 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Snx21-206ENSMUST00000174070 1446 ntTSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Gm11421-201ENSMUST00000122124 294 ntBASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Gm6899-201ENSMUST00000089614 622 ntAPPRIS P1 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Maf1-205ENSMUST00000160853 1651 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Morf4l1-211ENSMUST00000191189 1223 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Moap1-201ENSMUST00000173760 1312 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Gnb5-206ENSMUST00000215875 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Sox8Q04886 Cnpy3-202ENSMUST00000121671 561 ntTSL 2 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.3 ms