Protein–RNA interactions for Protein: Q04863

Relb, Transcription factor RelB, mousemouse

Predictions only

Length 558 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RelbQ04863 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.45■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Art5-204ENSMUST00000106937 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Sae1-201ENSMUST00000094815 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Gm14205-201ENSMUST00000138427 739 ntTSL 3 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.44■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Zmiz2-201ENSMUST00000012612 4199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Alkbh5-201ENSMUST00000044250 5730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Ccng2-201ENSMUST00000031331 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Fgfr2-217ENSMUST00000124096 2425 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Pbx1-202ENSMUST00000072863 1709 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Catsper2-201ENSMUST00000038073 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RelbQ04863 1700056E22Rik-201ENSMUST00000050306 967 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Supv3l1-201ENSMUST00000020273 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Stau2-217ENSMUST00000162751 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Klrg2-201ENSMUST00000096030 2276 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RelbQ04863 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Dhx33-204ENSMUST00000124464 1835 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Spint1-203ENSMUST00000110817 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RelbQ04863 AA543186-201ENSMUST00000180841 1696 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RelbQ04863 A930032L01Rik-201ENSMUST00000195845 957 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Gm43530-201ENSMUST00000195920 274 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RelbQ04863 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Siah1b-201ENSMUST00000037928 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Map2k2-202ENSMUST00000105331 1556 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Gpatch3-201ENSMUST00000030662 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Sema6d-203ENSMUST00000077847 6444 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
RelbQ04863 Stx18-202ENSMUST00000042146 1473 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Gm28050-202ENSMUST00000131029 663 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Tcf7l1-201ENSMUST00000069536 3042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Ttc9b-201ENSMUST00000008088 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Klhl15-205ENSMUST00000113916 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
RelbQ04863 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Rfk-201ENSMUST00000025617 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RelbQ04863 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RelbQ04863 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Ltbp4-205ENSMUST00000121175 5118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RelbQ04863 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Ung-202ENSMUST00000102584 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Rbm7-201ENSMUST00000170000 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.36■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
RelbQ04863 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms