Protein–RNA interactions for Protein: Q04519

Smpd1, Sphingomyelin phosphodiesterase, mousemouse

Predictions only

Length 627 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smpd1Q04519 Gm26995-201ENSMUST00000182216 1306 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Olfr94-201ENSMUST00000055324 1304 ntAPPRIS P2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Pick1-204ENSMUST00000163571 2054 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 1810059C17Rik-201ENSMUST00000125173 487 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Gadd45b-201ENSMUST00000015456 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Rras-201ENSMUST00000044111 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Dbf4-201ENSMUST00000002368 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Mcam-201ENSMUST00000034650 2989 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Gfra4-205ENSMUST00000110239 810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Zdhhc4-201ENSMUST00000001900 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Memo1-201ENSMUST00000078459 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Hopxos-201ENSMUST00000148568 1661 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Snhg20-202ENSMUST00000149822 593 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Dlx6-203ENSMUST00000171311 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Ccdc84-211ENSMUST00000217270 681 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Smpd1Q04519 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Kctd17-206ENSMUST00000162517 901 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Kctd17-209ENSMUST00000166142 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Mettl26-205ENSMUST00000169308 1026 ntTSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Mpzl1-210ENSMUST00000194437 643 ntTSL 3 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Hck-202ENSMUST00000109799 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Hck-203ENSMUST00000189688 2090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Hck-201ENSMUST00000003370 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Thap11-201ENSMUST00000040445 1819 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Zcrb1-208ENSMUST00000162160 850 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Slc39a7-203ENSMUST00000169397 2107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Ntf5-201ENSMUST00000058879 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Espn-205ENSMUST00000084114 1645 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Gm10571-201ENSMUST00000097869 1638 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Tmem234-215ENSMUST00000173758 453 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 H2-Ab1-201ENSMUST00000040828 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Dda1-202ENSMUST00000124745 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Rnf32-204ENSMUST00000160246 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Socs2-214ENSMUST00000172070 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Fdxacb1-203ENSMUST00000176335 1817 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Gm13234-201ENSMUST00000120010 747 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Gm12216-203ENSMUST00000121435 655 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Lsm2-201ENSMUST00000007266 873 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Shisa4-201ENSMUST00000041240 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Hsd17b2-201ENSMUST00000034304 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 1700017B05Rik-204ENSMUST00000215298 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Smpd1Q04519 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Ubl3-202ENSMUST00000164904 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Polr2j-202ENSMUST00000111127 900 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Gm44487-201ENSMUST00000205145 325 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Cystm1-201ENSMUST00000050584 831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Sept4-206ENSMUST00000122067 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Smpd1Q04519 Pomgnt1-203ENSMUST00000106498 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32 ms