Protein–RNA interactions for Protein: Q03146

Ddr1, Epithelial discoidin domain-containing receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddr1Q03146 Kndc1-202ENSMUST00000121839 2210 ntTSL 2 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Ptger3-202ENSMUST00000173533 2097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Ddr1Q03146 Stk3-202ENSMUST00000067033 2471 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Dedd2-201ENSMUST00000058702 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Lpcat3-201ENSMUST00000004381 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Cbln2-202ENSMUST00000122079 2549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Donson-203ENSMUST00000117159 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Zfp963-202ENSMUST00000154063 640 ntTSL 3 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Gm27151-202ENSMUST00000185015 1145 ntTSL 5 BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.75■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Prmt1-202ENSMUST00000107843 1508 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Oaz1-201ENSMUST00000060987 1071 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.74■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 D11Wsu47e-201ENSMUST00000042227 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Msantd3-203ENSMUST00000107704 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 AC166356.1-201ENSMUST00000228236 1426 ntBASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Zfp36l1-204ENSMUST00000219642 545 ntTSL 3 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Pou2f2-210ENSMUST00000176408 1697 ntTSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Tmem79-202ENSMUST00000107552 2063 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.73■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Gm10657-201ENSMUST00000193528 1031 ntBASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Sc5d-202ENSMUST00000169609 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Usp2-202ENSMUST00000065461 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Dvl3-203ENSMUST00000171572 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Dtnb-225ENSMUST00000174663 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Ssbp3-201ENSMUST00000030367 3195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Stac3-202ENSMUST00000160019 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Ddr1Q03146 Ccdc149-202ENSMUST00000198008 2470 ntTSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Ccne1-201ENSMUST00000108023 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Man2c1os-201ENSMUST00000125333 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Gp1bb-202ENSMUST00000167388 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Sco1-202ENSMUST00000108690 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 A030001D20Rik-201ENSMUST00000211533 1542 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Ppp2r2c-203ENSMUST00000201156 461 ntTSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 4930524B15Rik-201ENSMUST00000102829 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Sys1-202ENSMUST00000109352 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Stk35-201ENSMUST00000165413 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.69■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Gm26837-201ENSMUST00000180821 2110 ntTSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Mapkapk3-208ENSMUST00000192054 944 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Mtfmt-201ENSMUST00000074792 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Dll3-201ENSMUST00000108315 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Ddr1Q03146 Slc25a3-203ENSMUST00000164505 1483 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.4 ms