Protein–RNA interactions for Protein: Q02789

Cacna1s, Voltage-dependent L-type calcium channel subunit alpha-1S, mousemouse

Predictions only

Length 1,880 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cacna1sQ02789 Rpl26-202ENSMUST00000101014 657 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
Cacna1sQ02789 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Hnrnpa3-204ENSMUST00000111964 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Kazald1-202ENSMUST00000111948 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Ankrd33b-202ENSMUST00000076942 1641 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Akip1-201ENSMUST00000033335 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Gm1673-203ENSMUST00000114383 511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Kcne1l-201ENSMUST00000134825 1543 ntAPPRIS P1 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Bsg-201ENSMUST00000067036 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Cyp4f13-204ENSMUST00000139353 1389 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 8430422M14Rik-201ENSMUST00000199608 822 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Cdkn1c-201ENSMUST00000037287 1901 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Rps2-ps11-201ENSMUST00000195283 868 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Adssl1-202ENSMUST00000180015 1819 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Impa2-201ENSMUST00000025403 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Yeats4-201ENSMUST00000020382 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 a-202ENSMUST00000109697 705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
Cacna1sQ02789 Immp2l-203ENSMUST00000134965 977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Gm5913-201ENSMUST00000119397 1399 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Ccdc84-201ENSMUST00000053286 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Rian-206ENSMUST00000182119 329 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Klf13-204ENSMUST00000185175 487 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Tpst2-202ENSMUST00000071455 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Cfap20-201ENSMUST00000034249 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Trabd-206ENSMUST00000169891 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Ogfod2-202ENSMUST00000119269 1474 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Alx3-201ENSMUST00000014747 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Mir9-3hg-206ENSMUST00000182937 636 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Sptssa-201ENSMUST00000056228 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 A830035A12Rik-201ENSMUST00000147445 861 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Utp11-201ENSMUST00000030738 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Shq1-201ENSMUST00000089245 1638 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Caml-201ENSMUST00000021963 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Ntn5-202ENSMUST00000182750 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Rpf2-201ENSMUST00000045114 1853 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Cacna1sQ02789 H2-Q7-203ENSMUST00000078205 1419 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Fez1-201ENSMUST00000034630 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Tuba3a-201ENSMUST00000088246 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Cacna1sQ02789 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms