Protein–RNA interactions for Protein: Q02591

Gsc, Homeobox protein goosecoid, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GscQ02591 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GscQ02591 Mrpl38-201ENSMUST00000106439 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GscQ02591 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GscQ02591 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
GscQ02591 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
GscQ02591 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
GscQ02591 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GscQ02591 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GscQ02591 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC21.09■□□□□ 0.97
GscQ02591 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GscQ02591 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
GscQ02591 Ezh2-204ENSMUST00000114618 2775 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GscQ02591 Btbd2-201ENSMUST00000003434 3026 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GscQ02591 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GscQ02591 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GscQ02591 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GscQ02591 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
GscQ02591 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GscQ02591 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GscQ02591 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
GscQ02591 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GscQ02591 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
GscQ02591 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.96
GscQ02591 Baiap2-201ENSMUST00000026436 2394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GscQ02591 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GscQ02591 Pde1b-201ENSMUST00000023132 3218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
GscQ02591 Rab5c-201ENSMUST00000019317 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GscQ02591 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GscQ02591 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GscQ02591 Zfp213-201ENSMUST00000095606 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GscQ02591 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GscQ02591 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GscQ02591 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GscQ02591 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GscQ02591 Noa1-201ENSMUST00000047860 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GscQ02591 Cetn4-203ENSMUST00000102955 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GscQ02591 Pus1-203ENSMUST00000086643 1868 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GscQ02591 Spg7-211ENSMUST00000153285 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
GscQ02591 Gal3st3-201ENSMUST00000061169 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
GscQ02591 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
GscQ02591 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GscQ02591 Dolk-201ENSMUST00000100219 2104 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GscQ02591 Cdc20-201ENSMUST00000006565 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GscQ02591 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GscQ02591 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GscQ02591 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GscQ02591 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GscQ02591 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GscQ02591 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GscQ02591 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GscQ02591 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GscQ02591 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GscQ02591 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GscQ02591 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GscQ02591 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
GscQ02591 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
GscQ02591 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GscQ02591 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GscQ02591 Vps9d1-203ENSMUST00000122363 2952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GscQ02591 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GscQ02591 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
GscQ02591 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GscQ02591 Pth2-202ENSMUST00000210086 481 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GscQ02591 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GscQ02591 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GscQ02591 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GscQ02591 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
GscQ02591 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GscQ02591 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GscQ02591 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
GscQ02591 Epdr1-201ENSMUST00000002885 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GscQ02591 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GscQ02591 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GscQ02591 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GscQ02591 Gatad1-201ENSMUST00000007559 2545 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GscQ02591 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GscQ02591 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GscQ02591 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GscQ02591 Rnpep-201ENSMUST00000074357 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GscQ02591 Brsk2-205ENSMUST00000172652 2501 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GscQ02591 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
GscQ02591 Hoxb3os-201ENSMUST00000131275 2315 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
GscQ02591 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GscQ02591 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GscQ02591 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GscQ02591 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
GscQ02591 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GscQ02591 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GscQ02591 Rhbdd3-201ENSMUST00000036320 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
GscQ02591 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.96
GscQ02591 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC21.02■□□□□ 0.95
GscQ02591 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GscQ02591 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GscQ02591 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GscQ02591 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
GscQ02591 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GscQ02591 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
GscQ02591 Hsf1-204ENSMUST00000226872 2104 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
GscQ02591 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
GscQ02591 Cacnb1-203ENSMUST00000103144 2236 ntTSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms