Protein–RNA interactions for Protein: Q02284

Htr1f, 5-hydroxytryptamine receptor 1F, mousemouse

Predictions only

Length 366 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Htr1fQ02284 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Chtf8-201ENSMUST00000169312 2730 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Bmp2k-202ENSMUST00000112974 3244 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Acvrl1-202ENSMUST00000117984 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Lmtk3-204ENSMUST00000209617 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 AU022751-201ENSMUST00000101698 1838 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Ung-201ENSMUST00000031587 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Ralgps2-205ENSMUST00000185198 2229 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Zfp692-202ENSMUST00000153510 1887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Luc7l2-201ENSMUST00000057692 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Snx5-202ENSMUST00000110030 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Cers2-201ENSMUST00000015858 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Cstf2-202ENSMUST00000113286 2717 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Hnrnpl-211ENSMUST00000174548 2679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Htr1fQ02284 Gm4969-202ENSMUST00000141380 1892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Chtop-202ENSMUST00000049937 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Adpgk-201ENSMUST00000026266 2464 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Gfi1-203ENSMUST00000159164 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Tusc3-203ENSMUST00000209440 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Zfp653-201ENSMUST00000043922 2108 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Gpr137-204ENSMUST00000099782 1742 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Barx2-201ENSMUST00000116615 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Patz1-203ENSMUST00000094471 2930 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Hyal2-203ENSMUST00000193747 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Stoml2-201ENSMUST00000030169 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Sept7-202ENSMUST00000165594 2516 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Slc3a2-201ENSMUST00000010239 1819 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Rab34-202ENSMUST00000056241 1558 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Flot2-203ENSMUST00000100784 2699 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Ahcyl1-201ENSMUST00000029490 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Cdkn3-203ENSMUST00000227149 1952 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Sec24b-201ENSMUST00000001079 5128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.73■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Sigmar1-201ENSMUST00000059354 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Ascl1-201ENSMUST00000020243 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Tsc22d1-203ENSMUST00000101618 1043 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.72■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Gm15751-201ENSMUST00000134552 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Gab2-201ENSMUST00000004622 6168 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Kcnip2-201ENSMUST00000026247 1203 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Cerk-201ENSMUST00000044332 4518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
Htr1fQ02284 Gnas-206ENSMUST00000109084 1695 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
Htr1fQ02284 Six3os1-206ENSMUST00000175921 2737 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.7 ms