Protein–RNA interactions for Protein: Q02053

Uba1, Ubiquitin-like modifier-activating enzyme 1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,058 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba1Q02053 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uba1Q02053 3830408C21Rik-205ENSMUST00000225426 1898 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Uba1Q02053 Espn-210ENSMUST00000105656 1593 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uba1Q02053 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uba1Q02053 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uba1Q02053 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uba1Q02053 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uba1Q02053 Smad6-203ENSMUST00000179458 273 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Uba1Q02053 Ctf1-204ENSMUST00000206506 784 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uba1Q02053 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uba1Q02053 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Uba1Q02053 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uba1Q02053 Reep6-207ENSMUST00000186864 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Uba1Q02053 Tmem234-201ENSMUST00000102591 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Apoe-206ENSMUST00000174064 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 4930467K11Rik-201ENSMUST00000180831 723 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Pop7-201ENSMUST00000031728 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Sap18b-201ENSMUST00000074053 789 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Tmem114-201ENSMUST00000023400 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Exoc3l2-201ENSMUST00000011407 2200 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Asphd1-203ENSMUST00000106340 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Plac9b-203ENSMUST00000184142 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Stau2-201ENSMUST00000027052 2763 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Ankrd9-203ENSMUST00000135131 1563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Stmn4-201ENSMUST00000074523 1303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Hoxb6-202ENSMUST00000173432 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Otud5-203ENSMUST00000115666 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Gm26833-201ENSMUST00000180899 440 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Cdc34b-202ENSMUST00000188741 1252 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Cdc34-201ENSMUST00000020550 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Cdc34b-201ENSMUST00000021240 1233 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Laptm4a-201ENSMUST00000020909 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Crh-201ENSMUST00000061294 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Kctd20-204ENSMUST00000122163 2423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Gm29257-201ENSMUST00000186115 639 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Hist1h2bp-201ENSMUST00000102982 469 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Hacd1-203ENSMUST00000114753 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Cacnb1-202ENSMUST00000092736 1880 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Uckl1os-201ENSMUST00000122831 2018 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Uba1Q02053 Ap1ar-201ENSMUST00000051737 2662 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uba1Q02053 Zfp467-202ENSMUST00000114556 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uba1Q02053 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uba1Q02053 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uba1Q02053 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uba1Q02053 Cox6a1-201ENSMUST00000040154 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uba1Q02053 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uba1Q02053 Stac3-201ENSMUST00000035839 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uba1Q02053 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Uba1Q02053 Rab28-203ENSMUST00000201422 1697 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uba1Q02053 Vmn1r17-205ENSMUST00000228342 2230 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uba1Q02053 Hpca-204ENSMUST00000116444 1847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uba1Q02053 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uba1Q02053 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uba1Q02053 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uba1Q02053 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uba1Q02053 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uba1Q02053 Gm26682-201ENSMUST00000180850 1729 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Uba1Q02053 Sfmbt2-204ENSMUST00000114864 1901 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uba1Q02053 Tfdp2-202ENSMUST00000165120 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uba1Q02053 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uba1Q02053 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uba1Q02053 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uba1Q02053 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uba1Q02053 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uba1Q02053 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uba1Q02053 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uba1Q02053 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uba1Q02053 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Uba1Q02053 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms