Protein–RNA interactions for Protein: Q01231

Gja5, Gap junction alpha-5 protein, mousemouse

Predictions only

Length 358 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gja5Q01231 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Gm45015-201ENSMUST00000207943 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Gm13146-201ENSMUST00000118508 780 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Mcl1-202ENSMUST00000178686 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Akr1a1-201ENSMUST00000030455 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Gja5Q01231 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Ndufa12-204ENSMUST00000179990 566 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Bcl3-201ENSMUST00000120537 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Zfp637-201ENSMUST00000112858 650 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Zfp637-203ENSMUST00000112860 1231 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Gm5408-201ENSMUST00000197998 747 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Gm6365-201ENSMUST00000054711 744 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Arl4d-201ENSMUST00000039388 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Tpsg1-204ENSMUST00000160920 867 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Nnat-210ENSMUST00000173839 1135 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Mir7071-201ENSMUST00000184847 69 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Dtymk-201ENSMUST00000027503 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Zbtb7a-203ENSMUST00000119606 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Dedd2-202ENSMUST00000205271 1942 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 CT010467.1-202ENSMUST00000205406 714 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Tmem121-201ENSMUST00000058491 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Krtap5-3-202ENSMUST00000187512 1652 ntAPPRIS P2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Nrg3-203ENSMUST00000173780 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Gja5Q01231 Fance-202ENSMUST00000114801 1751 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Il23a-201ENSMUST00000026449 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 1700067K01Rik-203ENSMUST00000172548 986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Snrpd3-203ENSMUST00000220229 442 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Tmem239-201ENSMUST00000055421 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Gja5Q01231 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.8 ms