Protein–RNA interactions for Protein: Q01098

Grin2c, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2C, mousemouse

Predictions only

Length 1,239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2cQ01098 Tusc2-203ENSMUST00000193418 410 ntTSL 3 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Cox18-202ENSMUST00000118816 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Gm11175-202ENSMUST00000211380 408 ntTSL 3 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Zfp653-202ENSMUST00000179605 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Adrm1-201ENSMUST00000061437 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Rer1-201ENSMUST00000030914 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Dbnl-201ENSMUST00000020769 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Grin2cQ01098 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Sp5-201ENSMUST00000100043 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Dtymk-202ENSMUST00000112890 1055 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Ramp1-203ENSMUST00000188475 711 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Eda-201ENSMUST00000071453 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Ovol2-201ENSMUST00000037423 1539 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 AC121965.1-201ENSMUST00000221422 861 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Reep4-203ENSMUST00000226563 1444 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Cldn3-201ENSMUST00000094245 1259 ntAPPRIS P1 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Aurkb-202ENSMUST00000108666 1831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Gm7514-201ENSMUST00000209475 934 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC20.48■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 M5C1000I18Rik-202ENSMUST00000186205 1414 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Gm16076-201ENSMUST00000140116 480 ntTSL 3 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Mfap4-201ENSMUST00000040522 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Kcnip1-203ENSMUST00000109340 1840 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Prkar2b-201ENSMUST00000003079 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Cblc-201ENSMUST00000043822 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 0610010K14Rik-202ENSMUST00000021181 779 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Ap3s1-204ENSMUST00000225520 957 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Gm21988-202ENSMUST00000176268 1621 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.87
Grin2cQ01098 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Gm27801-201ENSMUST00000184174 223 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Rwdd1-201ENSMUST00000019917 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Grin2cQ01098 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms