Protein–RNA interactions for Protein: Q01097

Grin2b, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 2B, mousemouse

Predictions only

Length 1,482 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grin2bQ01097 Smkr-ps-202ENSMUST00000141679 901 ntTSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Grin2bQ01097 Gnai2-203ENSMUST00000192837 421 ntTSL 5 BASIC32.34■■■□□ 2.77
Grin2bQ01097 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
Grin2bQ01097 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Grin2bQ01097 Thoc6-201ENSMUST00000047436 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Grin2bQ01097 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Grin2bQ01097 Dalrd3-201ENSMUST00000019183 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Grin2bQ01097 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Grin2bQ01097 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC32.33■■■□□ 2.77
Grin2bQ01097 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Grin2bQ01097 Sfr1-201ENSMUST00000099353 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
Grin2bQ01097 Ache-209ENSMUST00000196208 1911 ntTSL 5 BASIC32.33■■■□□ 2.77
Grin2bQ01097 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Grin2bQ01097 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.32■■■□□ 2.76
Grin2bQ01097 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Grin2bQ01097 Neurog1-201ENSMUST00000058475 1686 ntAPPRIS P1 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Grin2bQ01097 2610528J11Rik-202ENSMUST00000106367 736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Grin2bQ01097 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Grin2bQ01097 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Grin2bQ01097 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.31■■■□□ 2.76
Grin2bQ01097 Gm21992-201ENSMUST00000172000 1434 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Grin2bQ01097 Gm21992-206ENSMUST00000179909 1435 ntTSL 5 BASIC32.31■■■□□ 2.76
Grin2bQ01097 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Grin2bQ01097 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.3■■■□□ 2.76
Grin2bQ01097 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Grin2bQ01097 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Grin2bQ01097 Jmjd7-201ENSMUST00000044675 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Grin2bQ01097 Gm11762-201ENSMUST00000135630 1705 ntTSL 1 (best) BASIC32.3■■■□□ 2.76
Grin2bQ01097 AV026068-208ENSMUST00000189098 286 ntTSL 5 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Grin2bQ01097 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC32.29■■■□□ 2.76
Grin2bQ01097 Nxph4-201ENSMUST00000095266 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Grin2bQ01097 Coro1a-209ENSMUST00000173108 1170 ntTSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Grin2bQ01097 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC32.28■■■□□ 2.76
Grin2bQ01097 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.28■■■□□ 2.76
Grin2bQ01097 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.28■■■□□ 2.76
Grin2bQ01097 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC32.27■■■□□ 2.76
Grin2bQ01097 Lypd3-201ENSMUST00000080718 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Grin2bQ01097 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Grin2bQ01097 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Grin2bQ01097 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Grin2bQ01097 4430402I18Rik-201ENSMUST00000025872 2152 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Grin2bQ01097 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC32.27■■■□□ 2.76
Grin2bQ01097 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Grin2bQ01097 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Grin2bQ01097 Foxj3-209ENSMUST00000162267 1391 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.76
Grin2bQ01097 Gm7290-201ENSMUST00000104990 617 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Gm12918-201ENSMUST00000120234 636 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Gm15710-201ENSMUST00000121821 636 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Gm38205-201ENSMUST00000192243 258 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Gm5075-201ENSMUST00000196916 622 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Rpl13-ps6-201ENSMUST00000079761 636 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Rpl13-ps3-201ENSMUST00000079960 624 ntBASIC32.26■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC32.26■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Tcap-201ENSMUST00000008021 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Gm7102-201ENSMUST00000180168 1624 ntAPPRIS P1 BASIC32.25■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC32.25■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Aifm2-201ENSMUST00000067857 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Aplf-201ENSMUST00000032130 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.24■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Hdhd2-206ENSMUST00000145634 1585 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.24■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC32.23■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Zbtb7a-204ENSMUST00000121840 1676 ntTSL 1 (best) BASIC32.23■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC32.23■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Prkar1b-201ENSMUST00000026973 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.22■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Foxi3-202ENSMUST00000163089 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC32.22■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.22■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 H2-Q7-201ENSMUST00000071951 1406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.21■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Gm8520-201ENSMUST00000186517 868 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC32.21■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC32.21■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Spint1-202ENSMUST00000110816 1913 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.2■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Gm13534-201ENSMUST00000121169 513 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC32.2■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Gm3807-201ENSMUST00000193520 1168 ntBASIC32.2■■■□□ 2.75
Grin2bQ01097 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 Camkk2-202ENSMUST00000196742 1084 ntTSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 Hikeshi-201ENSMUST00000075010 715 ntTSL 3 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 Csnk1a1-207ENSMUST00000166990 1860 ntTSL 5 BASIC32.19■■■□□ 2.74
Grin2bQ01097 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.19■■■□□ 2.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms