Protein–RNA interactions for Protein: Q00LT2

Prcd, Progressive rod-cone degeneration protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 53 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrcdQ00LT2 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Wasf3-201ENSMUST00000016143 5196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Adgrl1-207ENSMUST00000141158 8181 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Trp53rka-201ENSMUST00000039007 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Rnf44-208ENSMUST00000128257 1689 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Stard4-203ENSMUST00000119991 941 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
PrcdQ00LT2 AC152827.1-201ENSMUST00000221143 2189 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Creb1-204ENSMUST00000185594 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC13.96□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Slc35a2-209ENSMUST00000208397 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Rem2-202ENSMUST00000164766 1884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Syce3-201ENSMUST00000109314 448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Gm43759-201ENSMUST00000196925 1261 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Arhgap27os2-201ENSMUST00000123812 1390 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Rspo1-201ENSMUST00000030687 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Gpr62-201ENSMUST00000164834 1977 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Fam49b-202ENSMUST00000164532 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Mir6236-201ENSMUST00000184437 123 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Golgb1-201ENSMUST00000023534 498 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Zfp618-201ENSMUST00000030043 1582 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Gnb2-201ENSMUST00000031726 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Sh3bp1-204ENSMUST00000109698 1923 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Exosc4-201ENSMUST00000059045 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Glrx5-201ENSMUST00000021522 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Bfsp1-201ENSMUST00000028907 2372 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Gm8770-201ENSMUST00000121113 1109 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Wnt11-205ENSMUST00000167303 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Ier3ip1-201ENSMUST00000026487 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Pold2-201ENSMUST00000102922 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Trim3-203ENSMUST00000106791 2466 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Lmo2-208ENSMUST00000170926 1529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Krt8-ps-201ENSMUST00000208495 945 ntBASIC13.92□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Ppm1b-201ENSMUST00000080217 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Chd5-202ENSMUST00000030775 9486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Calml3-201ENSMUST00000077698 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 D630002J18Rik-201ENSMUST00000181854 1115 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Nr0b1-201ENSMUST00000026036 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Htra2-202ENSMUST00000113962 1305 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 D830036C21Rik-202ENSMUST00000208263 1548 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Naa20-202ENSMUST00000110000 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Tmem120b-202ENSMUST00000111619 1256 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 Rnf187-202ENSMUST00000217262 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
PrcdQ00LT2 C1ql4-201ENSMUST00000064462 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms