Protein–RNA interactions for Protein: Q00994

BEX3, Protein BEX3, humanhuman

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEX3Q00994 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 VPS53-216ENST00000574029 585 ntTSL 4 BASIC24.93■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 NDUFS3-201ENST00000263774 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 SOCS1-201ENST00000332029 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
BEX3Q00994 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
BEX3Q00994 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.4 ms