Protein–RNA interactions for Protein: Q00651

Itga4, Integrin alpha-4, mousemouse

Predictions only

Length 1,039 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itga4Q00651 Krtap5-5-201ENSMUST00000097942 1177 ntAPPRIS P1 BASIC20.33■□□□□ 0.85
Itga4Q00651 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Gyg-201ENSMUST00000118015 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Fgfrl1-202ENSMUST00000112560 2318 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Gm37035-201ENSMUST00000194809 2148 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Msl3l2-201ENSMUST00000063138 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Rhov-201ENSMUST00000037360 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Spock1-204ENSMUST00000186271 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Dgat1-201ENSMUST00000023214 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Ankrd9-201ENSMUST00000043459 1706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Rps2-201ENSMUST00000054289 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Letm2-201ENSMUST00000079160 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Hpse-202ENSMUST00000112908 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Ksr1-202ENSMUST00000108264 2748 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Rhoq-201ENSMUST00000024956 4151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Arhgdia-202ENSMUST00000106197 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Slc35b2-201ENSMUST00000041353 2326 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Pdcd2-205ENSMUST00000154293 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Kansl1-204ENSMUST00000106972 5427 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Krt5-201ENSMUST00000023709 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Dusp22-203ENSMUST00000110310 2319 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Tmem9-202ENSMUST00000117950 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Ost4-202ENSMUST00000132253 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Erh-201ENSMUST00000021559 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Whrn-204ENSMUST00000095037 2419 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Tfap2e-201ENSMUST00000048194 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Tmem86a-201ENSMUST00000010451 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Fam207a-201ENSMUST00000045454 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Dus1l-203ENSMUST00000106135 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Zbtb7a-202ENSMUST00000117956 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Tial1-209ENSMUST00000141126 1344 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Triobp-202ENSMUST00000109688 2553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Tsen54-201ENSMUST00000021134 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Gm6085-201ENSMUST00000182774 1470 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Rdh14-201ENSMUST00000020947 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Gm20621-202ENSMUST00000176618 1234 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Gm9922-201ENSMUST00000066461 435 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Itga4Q00651 Kdelr3-201ENSMUST00000010974 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Hras-207ENSMUST00000168550 2272 ntTSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Jkamp-202ENSMUST00000117449 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Fbxo2-201ENSMUST00000047951 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Pelo-201ENSMUST00000109226 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Cpsf4-202ENSMUST00000160422 1756 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Tomm40-202ENSMUST00000093552 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 C2cd4a-201ENSMUST00000054500 1395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Ugdh-201ENSMUST00000031103 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Dusp15-202ENSMUST00000109811 753 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Pkig-204ENSMUST00000126182 762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Gm7160-202ENSMUST00000188519 1027 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Arhgap27-202ENSMUST00000092557 1504 ntTSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Celf6-201ENSMUST00000034840 2765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Itga4Q00651 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms